·永曆皇帝·
福州既失，兩廣總督丁魁楚與廣西巡撫瞿式耜會議監國；而閣學兵部尚書呂大器自閩至、原任兵部尚書李永茂以守制並至。式耜首言監國永明王賢，且為神宗嫡孫，應立。永明王諱由榔，桂王之子。初封衡陽，以寇亂徙寓梧；會桂王已薨，永明猶在衰絰中也。於十月十四日監國，改元永曆。以肇慶府署為行宮，推置僚署有差。魁楚、大器俱為大學士，式耜以吏部右侍郎兼閣學、掌銓事；魁楚兼戎政、大器兼中樞，永茂請終制。而福建舊相蘇觀生、何吾騶俱遁回廣東，與布政使顧元鏡於十一月擁立隆武弟唐王聿■〈金粤〉監國，年號紹武；以都司署為行宮。
會贛州敗書至，司禮太監王坤趨永曆移梧避之。式耜謂：『今日之立，為祖宗雪仇恥，正宜奮大勇以號遠近。東人復不靖，苟自懦，外棄門戶、內釁蕭墻，國何以立』？爭之不得，遂移梧。
尋還肇慶。故大學士陳子壯書達式耜，請力馘蘇而趣兵東。永曆遣兵科給事彭耀往諭之。耀，粵東人，舊為秦令，有能聲；譬曉倫序監國先後、國家仇讎利害。觀生等殺耀於市，日集兵向肇慶。右司馬林佳鼎督兵靖東郊，東將詐降，陷佳鼎沒於水，東人益獗。
式耜疏言：『草昧之初，惟養聖德、修紀綱、慎政教、挽人心、布威武、起用人望、招徠賢俊為首務』。王坤者，固北閹；自南都失而入閩。隆武遣出，茲用司禮秉筆。有戶部郎中周鼎瀚，內批改給事中；瞿式耜力言不可，不聽。〔以〕粵巡使王化澄陞粵督，尋代佳鼎，晉少司馬，掌中樞（大器先以病去矣）；內批：陞化澄為大司馬。式耜疏言：『化澄誠賢，有廷論；斜封墨敕，何可為例？請補部疏，尚得體』。蓋汲汲為閹預慮也。
晉永茂大學士；茂守制，僉請專知經筵，不入直。茂疏薦十五人為十五省鄉望。疏上，王坤啟視，殊不悅。未幾，十四人皆硃之，山西道御史劉湘客一斥。永茂怫然曰：『朝廷方以經筵責茂，茂以十五省人進，非私也；斥湘客者，斥茂也』。即日解舟去。式耜疏言：『大臣論薦，新朝盛事。司禮輒去取其間，無以服御史，何以安大臣』？王坤復疏薦海內碩卿數十人；式耜又言：『司禮抑人不可，薦人更不可』。吏部都給事劉鼒等疏論坤內臣，不得薦人。永曆怒，叱逐鼒等；式耜力持之，得復用。
御史童琳參都御史周光夏越資序、題差用，私亂臺規非法；命廷杖琳。式耜力救，得免。
陞翰林院檢討方以智為中允。改御史劉湘客為編修，充經筵講官；坤不悅湘客，且疑劉鼒疏出以智手。以智放舟去（時十二月十五日）。
清總兵李成棟兵薄廣州，命前鋒數十人以紅布裹頭扮作廣軍，直至城下，奪門而入；副將杜永和擒紹武並周王、益王、遼王等，盡斬之。蘇觀生伏誅，顧元鏡、何吾騶皆投誠，百姓薙髮歸順。時有石、馬、徐、鄭四姓聯■〈舟宗〉海上，花山楊光林亦擁眾數萬，水陸交訌，民不聊生。成棟相機剿撫，於二十三日發兵往南韶而親下肇慶。
二十五日聞報，式耜請視師，督戰士駐峽口。王坤復請永曆西避之，式耜爭之不聽，遂駕小艇上西峽。
丁亥正月朔，至梧州。時丁魁楚惑於奸弁蘇聘，從梧西走岑溪；王化澄走潯州。隨行者，止式耜一人。
是月十六日，成棟克定肇慶，隨發副將楊文甫、張月領兵克取高、雷、廉三郡；即於二十九日一鼓而入梧州，廣西巡撫曹燁出降，梧屬俱遍令納印。及南雄、韶州二府報捷，別遣副將閻可義等前赴瓊州。
二月，永曆抵桂林。式耜肅殿陛，敕守禦；誕告楚、蜀各鎮：粵西居山川上游，桂誠可都，疏請道里之可達桂林者。王錫袞、文安之為相，周堪賡、郭都賢、劉遠生為六卿。時給事中丁時魁疏論新政，烺烺石劃；召掌禮科。給事中金堡素有清直聲，終制，敕召還。何騰蛟晉閣學督師。
而丁魁楚在岑溪屯兵千餘，清人招之不服；乃水陸設伏，大戰藤江，丁兵敗，魁楚中箭死之。隰江、平樂相繼投降，高、雷、廉三府俱報捷。四月，清兵渡海克瓊州。
方警報之疊至也，王坤又趣永曆往楚。式耜上疏，言勝敗存亡、山川要害甚激切；略曰：『駕不幸楚，楚師得以展布，自有出楚之期；茲半年之內，三、四播遷，民心、兵心狐疑局促，如飛瓦翻手散而覆手合』。又曰：『在粵而粵在、去粵而粵危。我進一步，則人亦進一步；我去速一日，則人來亦速一日』。又曰：『楚不可遽往，粵不可輕棄。今日勿遽往，則往也易；今日若輕棄，則更入也難』。又曰：『海內幅員，止此一隅。以全盛視西粵，則一隅似小；而就粵西恢中原，則一隅甚大。若棄而不守，愚者亦知其拱手送矣』。擎跪涕泣，不可挽。無已，請身留桂。乃命式耜留守桂林，各路悉秉節制。式耜仍疏請暫駐全州，以扼楚、粵之中。
當平樂之不守也，清兵直薄桂林。三月十一日，衝入文昌門，城中大恐。時焦璉自全甫歸，從者數百人控弦提刃，與清兵接戰；稍卻之。清兵屯陽朔，遍野俱薙髮。式耜與璉危城孤守，疏詣全，徵安國公劉承胤兵。承胤初從武岡入護，猶持正守法，逐司禮王坤為弄權，面叱周鼎瀚為奉寺鼻息；故雅重式耜，發兵數千援桂。未幾，承胤請金吾郭承昊、馬吉翔、嚴雲從封伯；御史毛壽登駁參金吾無矢石功，何得援邊鎮例晉五等？
吉翔等疑疏出湘客指，鼎瀚遂造蜚語，為董卓、■〈榷，氵代木〉、氾之議，激承胤怒，偪永曆立命廷杖，而縛壽登、湘客及御史吳德操、給事中萬六吉於午門外。會諸臣申救，得免；壽登等俱落職。承胤益橫，脅劫永曆幸武岡。式耜疏留全陽，曰：『聞郊社禮成，即圖移駕；不知移駕將回桂林耶？抑幸武岡、辰、沅耶？今日原以恢復兩粵為心，則不徒西粵未恢不可移動，即東粵未恢亦且當駐全也』。故承胤等嗾杖湘客等，以湘主還蹕桂林之議也。承胤諸部至桂，挾餉不出兵。式耜搜括庫藏而外，捐囊萬金；夫人邵亦捐簪珥數百。兵卒不肯出，與焦兵主客不和，譁變擊鬥，掠市而去（為五月十四日）。永曆竟駐武岡。
五月二十五日，清兵偵兵變，積雨城壞，環攻桂城；吏士皆無人色。璉負創奮臂呼督師、撫按，肘羽腹石，分門嬰守；用西洋銃擊中馬騎。尋出城戰，奮勇擊殺。自辰抵午，不及餐；式耜括署中米蒸飯分哺之，士卒俱樂用命。明日復出戰，清兵旋去。式耜先令路將馬之驥伏於隔江犄角接應，固圍倍慎。是三月之內，危於清、亂於兵，式耜一手指揮，璉乃得底定。璉久將桂，得桂人心；式耜國士遇之，故獨得璉死力。
以保桂功，進式耜兼太子太師、臨桂世伯；式耜辭不拜。疏上不允，復請告自劾；言『自二月十五日以迄五月二十九日，凡百六日中，遇變者三，皆極危險；變故當前，總辦一「死」字，亦遂不生恐怖、不起愁煩。惟是臣之病，不獨在身而在心、不徒在形而在神；身與形之病可療也，心與神之病不可醫也』。又疏再請返蹕全陽，卒不聽。乃督璉恢朔、下平；邦傳由賓、柳亦及潯，並復梧。至八月，具疏上言粵西全定，請還桂林，昭告興陵。
時巡道嚴起恆以儀表魁梧，拜大學士。
督師何騰蛟駐衡州、堵胤錫駐長沙。詎清三王平定長沙，而衡州相繼盡失。總兵黃朝選、楊國棟等被執，屍幾斷流。八月二十四日，武崗復敗。永曆又播越入粵，次柳州。式耜累疏，極言『不可他移一步。滇、黔地荒勢隔，忠義心渙。三百年之土地僅存粵西一線，且山川形勝、兵馬糗糧俱有可恃』。時督師何騰蛟、新輔嚴起恆及劉湘客咸至桂，南安侯郝永忠率兵驟至，宜章伯盧鼎亦至自楚，式耜復疏，極言『柳州猺獞雜處，地瘠民貧，不可久駐；慶遠壤鄰黔、粵，南寧地偪交彝，不可遠幸』。時騰蛟與永忠、鼎、璉等俱分防任汛。
會土司覃裕春子鳴珂與道臣龍文明搆兵，永曆復次象州。式耜與騰蛟、起恆、湘客等籌畫調和主客，集永忠、璉誓於神，刻期出師；宜章鼎與滇鎮總兵趙印選遂各分路駐全。全洲戰勝，諸帥連營而軍。清兵因次楚。
十一月，永曆自象州抵桂，式耜與起恆並相。司禮龐天壽七月請催兵下梧，久在粵；舊司禮王坤被承胤逐者復入。自武崗至柳、至象，票擬皆金吾吉翔手也。式耜疏請永曆攬大權、明賞罰、嚴好惡、親正人、聞正言，威德兼行，以服遠近；時謂名言。
騰蛟再督師出全，兵益不睦；璉下平樂、永忠壁興安。未幾，永忠營被襲，疾至闕，欲撤兵。左右禁近，刻期欲永曆遷。式耜持不可，言『督師警報未至，諸營夜驚無大恐；二百里外風塵，而遽使主露處耶？播遷無寧日，國勢愈弱、兵氣愈難振，民心皇皇復何依？潮回波遊，雖長年三老，能逆挽其戙杙哉』？左右禁近周勢不能止。式耜又請曰：『無已，候督師歸；果急，甲士正山立，觀兵督戰，咫尺威嚴，勸激將士，背城借一，勝敗未知。若以走為策，桂城危、柳益危；若今日可到桂，明日亦可到南太』。反覆數百言，淚下沾衣。嚴起恆曰：『遲至厥明五鼓』。甫夜半，而永曆已行矣；是戊子二月二十二日也。
時潰兵肆掠，蹂躪公署，職官無一得免；式耜被逼登舟。黎明，刑部侍郎遠生、給事中丁時魁、萬六吉及湘客俱至；蓋湘客奉命安撫亂亡及勸餉糈，而遠生、時魁以召將入也。遇式耜於樟木港，式耜集遠生等入民屋，立草檄分路四發；蹔駐陽朔，催璉兵上援。楚鎮周金湯、熊兆佐亦入桂；又檄翰林簡討蔡之俊、大理寺評事朱盛瀫先入桂。宣式耜令，檄按察司僉事邵之驊部璉兵，定人心。式耜於初一日復入桂署。督師騰蛟自永寧至，滇鎮胡一青統兵至，璉自平樂統兵至。清兵疑桂城空虛，直抵桂北門。三月二十二日，騰蛟督兵三面禦之，清兵渡甘棠去。督師列營榕江。
永曆詔旌式耜，賜銀幣，又賜「精忠貫日」金圖書一枚。式耜念主宵衣南寧蠻鄉，不可久駐，日為永曆清道。前日所憂在內者，今更在外。督勳鎮將士直取全州。
促巡撫魯可藻下梧，會東人有反歸信，令可藻繕兵以待。會可藻銜自署兩廣。舊例：東撫稱制兼粵西，西撫稱撫。式耜曰：『方今武人多自署撫，軍帥一面牽制輒自命，貽遠人笑；予代疏請銜，曷不可』？周鼎瀚以閣部擅，式耜亦疏正之。當武崗之亂，言官彈鼎瀚以附承胤入直；式耜司票擬，獨不苛。王沂公曰：『進賢、退不肖，皆有體。瀚係大臣，應聽自謝免；不謝免而復擅假，毋乃不可乎』？邦傳稱粵西世守，牒四飛。式耜疏駁之：『今日功晉五等，尚未裂土。海宇剝削，止粵西一隅為駐蹕之地，楚、滇數萬之師日需食；輒曰：「世守」，豈老成憂國所隱料』？式耜身在雖外，在廷大紀綱，極言力請；疏曰：『臣與陛下患難相隨、休戚與共，原自不同於諸臣；一切大政，自得與聞。廟議可否，眾指所關。本亂而求末治，馬阤終古耳』。
永曆駐南寧。四月初一日，世子生，冊為太子，赦天下，詔曰「萬喜」。
式耜念無講官，經筵不御，石室塵封，何由聞得失；手書「八箴」於扇，進之。
督師騰蛟復全陽，是五月二十七日事也。督師報功疏，不肯自為功；有曰：『為陛下以信臣、用臣者，式耜一人也』。
六月，粵東李成棟來歸。先是，成棟下廣，收繳印信凡五十餘顆，於中獨取「總督」印藏之。有愛妾某，松江妓也；揣知其意，因朝夕慫惥。成棟撫几曰：『憐此雲間眷屬也』。妾曰：『我獨敢富貴乎？先死尊前，以成君子之志』。遂自刎頸。成棟抱尸大哭。明日即衣冠，將「總督」印具疏迎駕。又江右金聲桓據南昌，藏表疏於佛經部面中，遣使賫奏亦至，兩粵俱稱全土。式耜疏請往桂，又請永曆勿遽東；又言『事權宜專，號令宜一。茲軍功爵賞、文武署置決於成棟，若歸之朝廷則中擾，閫外不能專制；聽之，朝廷徒虛拱。且楚、黔雄師百萬，騰蛟翹首威靈，如望雲霓。車駕既東，軍中將帥謂朝廷樂新復之土，成棟亦有邀駕之嫌。號令既遠，則人心渙散。請一見東諸侯，俾共瞻至尊音容，面為慰勞指屬，然後責其盡意於東，刻期出戰，咸決於外、不中擾也』。又疏令簡討蔡之俊入迎，再疏令給事中蒙正發迎。永曆竟由梧入肇；先後諸疏，俱不報。式耜聞，淚簌簌下；再疏謂：『前日粵東未復，則宜住桂以規楚；今日江、廣反正，則宜住桂以圖出楚。事機所在，毫釐千里』。吏部侍郎吳貞毓疏請永曆往廣城，式耜乃促遠生入阻永曆。適成棟自嶺還師，修行宮，且迓駕。永曆命遠生詣廣勞師，遠生謂成棟曰：『今駕駐此，爵賞征伐，人疑有私，不可不嫌』。成棟然之，遂罷行宮、止迓駕。成棟具疏，言『式耜擁戴元臣，粵西扼禦定，毋容久於外；應亟召還綸扉』。永曆專命遣官三、四召，式耜曰：『前日在南寧，桂林危；桂林危，則天下去矣，其機在外不在內也。今江、廣悉定，何公督師下星沙，朝臣且輻至，予不敢忍危而即安』。具疏乞骸，再上不允。
己丑正月，清兵破湘潭，何騰蛟被執。初，騰蛟檄各處兵馬齊集湘潭，而命馬進忠等由益陽抄出長沙下，邀截上下舟船，焚掠湘陽，斷絕水道。一隻虎率大隊復至長沙，絡繹攻圍。值清援兵合至，戰勝於湘潭；騰蛟被擒，斬之。
二月，清兵破信豐，李成棟歿於陣，南昌敗書復再聞。先是，聲桓據南昌，清兵晝夜攻擊，破之；王得仁被斬、聲桓赴水死。於是先後贈騰蛟中湘王、成棟寧夏王、聲桓〔豫章〕王、永曆設壇掛帛，皆■〈扌攵〉淚親祭。專命式耜留守督歸，兼江、楚各省兵馬。
永州兵再退，式耜疏請兵科給事中吳其靁監各營軍再出。當永曆駐肇慶，疏奏諄諄，以歲月稍暇、財賦優裕，用心盡力修內治以自固、嚴外備以自強，且積弊之後，易致中興也。一才一藝之士，靡不收羅幕府。每慨人才凋零殆盡，凡趼足而至者，非懷忠抱義之人，亦亂世取功名之士。人之歲月精神不用之於正，則用之於邪；安可驅為他人用？故人咸以桂林為稷下。
四月，雲南張獻忠養子孫可望遣龔彝之弟龔鼎獻黃金二十兩、馬四匹，移書求封親王名號。給事中金堡固爭，以為祖制無有。而廣西南寧府與雲南廣南府錯趾，可望來書有「不允封號，即提兵出戰」等語。陳邦傳恐甚，先封秦王，尋封為荊郡王；可望不受後封。
時楚制堵胤錫以楚敗達肇慶，滇營自永、全還桂，與焦兵猜疑生隙。
忠貞營自蜀轉戰，由楚至梧休息甲士。
清遣使貽書招式耜，式耜不從。
永州再報失利，興寧侯胡一青兵還榕江；式耜復辦糧械，趨出兵屯於全。民力窮竭，誅割無術，槁悴萬狀。永曆聞，為廢食；召廷臣議於慈寧宮，發東餉一萬兩。
是時清兵圍困曾慶於平和；尋出降，殺之。而詔安等處一時俱歸於清。鄭芝鵬據石榴城，清兵至，隨遁去。劉中藻在福寧勢窮，自縊。福建盡失，惟延、漳、汀三府界連江右，而延平所屬皆處萬山中。清兵既迴，遂立德化王朱慈燁據將軍寨，先陷大田、繼破龍溪，攻順昌、將樂。至十一月，清兵攻破之；王被獲，兵部尚書羅南生等降。
庚寅正月，南雄報不守，寶豐伯羅耀成棄韶州；永曆震恐，戒舟西上。戎政遠生奏自請行清遠，給事中金堡特奏請留，爭之不得。適式耜疏至，曰：『粵東水多於山，雖良騎不能野合。自成棟歸順，始有寧宇，財賦繁盛二十倍於粵西；衣甲糧餉，內可自強、外可備敵。材官兵士南北相雜，制勝、致王，可操券而求。難得而易失，莫此雲急。且韶去肇數百里，強弩乘城、堅營固守，亦可待勤王兵四至。何乃朝聞警而夕登舟』？疏再上，而永曆移德慶、抵梧州矣。蓋自成棟首疏文武各還事權，言官正氣宜獎，鹵簿不得干機務；失權者意。故急欲永曆移舟，棄東如屣。
時詞諫諸臣正綱紀、慎名器，多失人意。而御史程源輩以攫官不得，伺權者指，攻其所必去，熒惑永曆聽，下給事中丁魁楚、金堡、蒙止發及侍郎劉湘客詔獄。式耜聞報，上疏申救，謂『中興之初，宜保元氣、勿濫刑』。再疏爭之曰：『詔獄追贓，乃熹廟朝魏忠賢弄權鍛鍊楊、左事，何可祖而行之』？頒敕布四人罪狀；非永曆意，敕出忌者之手。式耜封還，謂『法者，天下之至公也。不可以蜚語飲章，橫加考案，開天下之疑。且四人得罪，各有本末；臣在政府若不言，恐失遠近人望，其何辭於後世』！凡七疏。遣孫昌文入見梧州，陳說粵西民貧食盡軍曲折（？）。時昌文孑身由海上來也。閣試，授昌文翰林簡討。
清兵再薄全州，衛國一青兵撤守榕江。
時勳帥咸進公，次者侯與伯；桂林牙門相望，號令紛出。
十一月初五日辰，報清兵大舉入嚴關；印選、一青、永祚俱以分餉入桂，榕江空壁。武陵侯楊國棟、寧武伯馬養麟方馳出小路軍榕江，兵未戰而四潰。發使趨印選，印選已出城，城中大亂，沿道驅掠。式耜令戢不得，城外鳥散，一青、永祚從城外去。式耜衣冠危坐署中，適總督張同敞自靈州回，過江東，不入寓，過式耜署曰：『事迫矣！公將奈何』？式耜曰：『封疆之臣，知有封疆；封疆既失，身將安往』？同敞曰：『公言是矣！君恩、師義，敞當共之』。遂笑與式耜飲。家人泣請身出危城，號召諸勳，再圖恢復。式耜揮去，不從。厥明被執，見清定南王孔有德；式耜以死自誓，不復一言。命幽式耜、同敞於別所。式耜賦詩，日與同敞賡和。至閏十一月十七日，斬之。其絕命詩有云：『從容待死與城亡，千古忠臣自主張；三百年來恩澤久，頭絲猶帶滿天香』。死之日，冬雷電大發，遠近皆為稱異。時給事中金堡已削髮為僧，上書孔有德請葬式耜、同敞；而吳江有楊■〈禾丸〉，為具衣冠棺殮，並同敞瘞於北門之園。
永曆上南寧，入土州；嚴起恆、王化澄、馬吉翔、龐天壽皆隨去。後未詳云。
