官署名。明永乐十九年(1421)迁都北京，兵部随迁。洪熙元年(1425)始于南京复置。正统六年(1441)定制为南京兵部掌南京军务。设尚书参赞机务一人，右侍郎一人。所属武选、职方、车驾、武库四清吏司各设郎中一人，职方、车驾二清吏司各设员外郎一人，武选、职方、武库三清吏司各设主事一人，车驾司二人。下设典牧所、会同馆、大胜关等。宣德八年(1433)始以尚书参赞机务。成化后，专以南京兵部尚书参赞机务，同内外守备官，共掌操练军马，抚恤民众，维持治安，振举庶务。在南京六部中职任最重。