樊深字文深，河东猗氏人。

　　早年丧母，侍奉继母十分恭谨。

　　少年好学，背着书到三河拜师，讲习《五经》，昼夜不倦。

　　魏永安年间，随军征战，以功劳授荡寇将军，先后升任伏波将军、征虏将军、中散大夫。

　　曾在读书时见到吾丘子，于是回家侍奉父母。

　　魏孝武帝西迁后，樊、王两姓聚众举义，被东魏所杀。

　　樊深的父亲樊保周、叔父樊欢周同时被害。

　　樊深在逃跑时，坠下悬崖，摔伤足部，两天没有吃饭。

　　后来看见一筐面饼，很想吃，但是又想到继母年老瘫痪，或许未被掳去，就忍住不吃。

　　夜里爬着寻找母亲，偶然相遇，拿给母亲吃。

　　回家以后，又立即逃走，改换姓名，在汾州、晋州之间求学，学习天文历算之术。

　　后来被人告发，押送河东。

　　适逢魏国将领韩轨的长史张曜看重他的儒学，请他到自己家，樊深乘此得以隐居。

　　太祖平定河东以后，追赠樊保周为南郢州刺史，樊欢周为仪同三司。

　　樊深回去安葬父亲，背土垒起坟茔。

　　不久，于谨引荐他担任府参军，让他在馆内教授子孙。

　　授抚军将军、银青光禄大夫，升任开府属，转任从事中郎。

　　于谨任司空后，让樊深担任咨议。

　　大统十五年(549)，代理下圭阝县令。

　　太祖在东馆设学，教授众将子弟，让樊深担任博士。

　　樊深经学渊博，每次讲解，都多次征引汉、魏以来各家解释，再进行阐发。

　　所以后辈人对他的讲解无法领悟，都在背后讽刺他说：“樊生讲解征引多家，无法理解。”但是儒师们都推崇他知识广博。

　　樊深生性好学，到老也不懈怠。

　　早晚往返，常常坐在马上读书，以致坐骑受惊而摔到地下，折断手脚，但始终不改。

　　后来授国子博士，赐姓万纽于氏。

　　设置六官后，授太学助教，升博士，加车骑大将军、仪同三司衔。

　　天和二年(567)，升县伯中大夫，加开府仪同三司衔。

　　建德元年(572)，上表请求退休，诏命允许。

　　朝廷有什么疑难，还常常召他询问。

　　后来因病去世。

　　樊深不仅专心习经，还泛读各种史书，以及《三苍》、《尔雅》、书法、阴阳、占卜之类的书。

　　他的学识虽然渊博，但口才不行，因此不被当时人称许。

　　著有《孝经》一卷、《丧服问疑》一卷、《七经异同说》三卷、《义纲略论》及《目录》三十一卷，都在世上流传。