1932年析伊宁县置，属新疆省。治所即今新疆巩留县。

在新疆维吾尔自治区境西部。属伊犁哈萨克自治州。面积 4528 平方千米。人口16万，有哈萨克、汉、维吾尔、回、锡伯等民族，其中哈萨克族占30.0%、维吾尔族占23.5%、回族占11.4%。辖1镇、7乡和6农牧林场。县人民政府驻巩留镇。县境为伊犁河三大支流巩乃斯河、特克斯河、喀什河交汇处，又名托古斯塔留，突厥语意为九源或九条河。1930年析伊宁县置巩留县，取辖地巩乃斯、托古斯塔留两地首尾两字名“巩留”。1949年属伊犁专区。1955年直属伊犁哈萨克自治州。1984年属伊犁地区。2001年复属伊犁哈萨克自治州。县境在中天山山间谷地，东南以山地为主，海拔 3000～4000 米，最高峰喀班巴依乔克峰 4257 米。西北河谷平原海拔700～900米。属中温带大陆性半干旱气候。林地面积约6.7万公顷，为天山西部主要林区之一，树种以雪岭云杉为主，野生核桃林约45公顷，均辟有保护区。野生动植物有雪豹、棕熊、金雕、鸨和甘草、沙棘、贝母、野生草莓、苹果等。农用地占土地总面积19.67%，天然牧地占58.02%。为半农半牧业县。农产以小麦、玉米、稻、胡麻为主。盛产瓜果，以苹果为大宗。牲畜以马、牛、羊、驼、驴为主，优良杂交夏洛来牛产于此。矿产有铁、绿柱石、沙金等。工业有采煤、建材、农机修配、粮油加工、乳品、酿酒、皮革等厂矿，手工业以帕拉斯地毯闻名。墩昭公路经雅玛图(喀什河在此汇入伊犁河)大桥入境，则旱公路横贯全县并接218国道。名胜古迹有塞人、乌孙人、突厥人墓葬和雪岭云杉自然保护区、野生核桃自然保护区、恰西、库勒德宁、大小莫乎尔等风景区。