四卷。清黄元御(生平事迹详见《周易悬象》)撰。此书为黄氏研究《内经》心得。所以称为“素灵微蕴”，是因黄氏以《素问》、《灵枢》等经典著作为本，阐发其中精微奥妙之义蕴。书成于乾隆十九年(1754)。书中载有胎化、脏象、经脉、营卫、脏候、五色、五声、问法、诊法、医方、齁喘解、吐血解、惊悸解、消渴解等二十六篇医论，后又附以医案。论述了人体生理、病理以及内、外、妇等科病证。多有独特见解。然黄氏推崇《内经》、秦越人、仲景之说，却对历代诸贤多有贬斥，如认为钱乙悖谬，李杲昏蒙，刘完素、朱震亨罪孽深重，颇多偏见。有道光间刻本，民国元年(1911)上海江左书林石印本。