四卷。唐代释吉藏撰。吉藏生平事迹详见《华严经游意》辞条。《十二门论》是印度僧人龙树所著，为中论提纲。姚秦三藏法师鸠摩罗什译。《十二门论疏》作于大业四年(608)，卷初先解释僧睿《十二门论序》，接着便以五意，即：释名第，根本有、无、同、异阐明《十二门论》大意。玄义中谓初有三门求有法不可得，名为空门，次有六门求相无从，为无相门。后有三门求起作无从，即无作门。在初三门中解释空门，在四门中解释无初门，在后五门中解释无作门。正判中列举六变。该疏释意玄气挺畅，清穆易晓。虽不及中观论疏之广博，但在精细明彻方面却优于中观论疏。仍不失为是研习三论的必读书。原续藏经本作六卷，后金陵刻经处本汇入论文作四卷。现有金陵刻经处刻本。